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cibermudezs@unal.edu.co
TEL. 3165000
Ext. 11321
Facultad
Ciencias
Departamento
Biología - Oficina 207
Sede
Bogotá

Clara Isabel Bermúdez Santana

Profesor Asociado / Tiempo Completo

Perfil Profesional

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Bióloga, M. Sc., Dr. rer. nat.

Areas de Interes

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  • Estudios de transcriptoma
  • Biologia del RNA
  • Estudio de estructura de ácidos nucléicos

Areas de Investigación

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  • Análisis de transcriptoma
  • Organización genómica de RNAs no codificantes
  • Descriptores de origen cuántico y grafo-teórico para caracterizar RNAs

Publicaciones

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Publicaciones Internacionales
  • Genomic organization of eukaryotic tRNAs. Bermudez-Santana, C., Stephan-Otto Attolini, C. Kirsten, T., Engelhardt, J., Prohaska, S., Steigele, S., Stadler, P. F. BMC Genomics 2010, 11:270
  • Identification and Classification of Small RNAs in Transcriptome Sequence Data D. Langenberger, C.I. Bermudez-Santana, P.F. Stadler, S. Hoffmann Pac Symp Biocomput. 2010:80-7
  • Evidence for Human microRNA-Offset RNAs in Small RNA Sequencing Data David Langenberger, Clara Bermudez-Santana, Jana Hertel, Philipp Khaitovich, Steve Hoffmann, Peter F. Stadler Bioinformatics. 2009 Sep 15;25(18):2298-301.
Libros publicados
  • Evolutionary Genomics: Chapter :Evolutionary genomics of microRNAs and their relatives. Andrea Tanzer, Markus Riester, Jana Hertel, Clara Isabel Bermudez-Santana, Jan Gorodkin, Ivo L. Hofacker, and Peter F. Stadler. In Gustavo Caetano-Anolles, editor, Wiley, 2010.
Tesis de pregrado
  • Un modelo para caracterizar la estructura secundaria de los ARNt isoaceptores de E. Coli utilizando teoría de grafos. Departamento de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia, 1997
Tesis postgrado
  • Caracterización de ARNts como modelo para establecer correlaciones estructura--función biológica, Facultad de Medicina, Universidad Nacional de Colombia, 2004
  • tRNomics: genomic organization and processing patterns of tRNAs, Faculty of Mathematics and Informatics, Leipzig University, 2010

Membresías

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  • Bioinformatics, Leipzig, Germany
  • Grupo de Química Teórica
  • Grupo de Biología Molecular Teórica y Evolutiva

Distinciones

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  • Tesis de Doctorado: Magna cum laude, 2010. Universidad de Leipzig, Alemania
  • Becario DAAD, programa Alecol, 2006-2010
  • Tesis de Maestría, Mención meritoría, 2004, Universidad Nacional de Colombia

Participaciones en Eventos

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  • RECOMB 2010 - 14th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology, Lisbon, Portugal
  • German Conference of Bioinformatics, 2009. Halle, Germany
  • Graph Modelling of tRNA isoaceptor molecules L.E. Andrade, C.I. Bermudez & E. Daza. Séptima Conferencia Internacional en Química Matemática. Mayo 25 - 31 de 1997. Girona, España
  • Caracterización de la estructura química del brazo aceptor del tRNA a partir de la distribución de carga: la importancia de la base diferenciadora. R. M. Marín, C.I. Bermúdez, E.E. Daza. Congreso de Químicos Teóricos de Expresión Latina, QUITEL, 2005. Islas Margaritas, Venezuela. POSTER
  • Clasificación de los anticodones a partir de un conjunto isoprotónico. J.F. Galindo, C.I. Bermúdez, E.E. Daza. XXXI Congreso de Químicos Teóricos de Expresión Latina, QUITEL, 2005. Islas Margaritas, Venezuela. POSTER
  • Un modelo de estructura química para tRNAs mediante grafos ponderados cuánticamente. J.F. Galindo, C.I. Bermúdez, E.E. Daza. Congreso de Químicos Teóricos de Expresión Latina, QUITEL, 2005. Islas Margaritas, Venezuela. POSTER

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